Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASKO14936 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASKO14936 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CASKO14936 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CASKO14936 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms