Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 HIVEP3-202ENST00000372584 12319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 NBPF12-202ENST00000579935 5035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 CSMD2-205ENST00000373381 13698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 MFN1-205ENST00000471841 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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