Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00319-202ENST00000448049 3507 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PAMR1-208ENST00000621476 2842 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 WASHC2A-201ENST00000282633 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CSNK2A1-202ENST00000349736 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MLH1-216ENST00000458205 2608 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 POTEJ-201ENST00000409602 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D27-201ENST00000261651 4838 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RBMXL1-202ENST00000399794 5084 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF223-201ENST00000434772 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRE1-204ENST00000381407 2687 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01291-201ENST00000377469 3662 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHDC4-205ENST00000446344 4444 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 HEATR9-207ENST00000604834 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PPM1L-202ENST00000464260 2735 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC16B-201ENST00000308284 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGA11-201ENST00000315757 3955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087762.2-201ENST00000639346 3773 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LILRB1-201ENST00000324602 2774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LILRB2-204ENST00000391749 2286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AP4S1-211ENST00000616371 4595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MYH11-203ENST00000452625 6886 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PSENEN-201ENST00000222266 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 OBP2A-202ENST00000342114 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV2D-26-201ENST00000390268 390 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC131097.2-201ENST00000404031 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM14-203ENST00000409372 876 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RHOA-IT1-201ENST00000428083 517 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP9-10P-201ENST00000435672 207 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC140481.1-202ENST00000436488 525 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL445933.2-201ENST00000440249 265 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC48A1-202ENST00000442892 1024 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009022.1-201ENST00000472115 496 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP5G1-204ENST00000503641 539 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 OR2AT1P-201ENST00000525935 743 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms