Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SYNE1-217ENST00000466159 2610 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DGCR2-205ENST00000537045 4361 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GTF2I-218ENST00000620879 4352 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CAMK1G-201ENST00000009105 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ABI1-205ENST00000376139 3516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DCBLD2-202ENST00000326857 3959 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DGCR8-202ENST00000383024 4419 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP8B3-202ENST00000525591 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PIP5K1A-203ENST00000368890 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PRAMEF8-201ENST00000357367 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NUP98-205ENST00000397007 3698 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ARL4A-203ENST00000396663 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RAD17-213ENST00000509734 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RNF4-222ENST00000541204 2796 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ENDOU-201ENST00000229003 2332 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MEP1B-204ENST00000581447 2308 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNJ15-207ENST00000398934 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC00939-202ENST00000507313 2819 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CUL1-202ENST00000409469 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FPGT-TNNI3K-206ENST00000557284 2855 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CDK5RAP1-210ENST00000473997 1930 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 UTP14A-202ENST00000425117 2403 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MFAP3L-201ENST00000361618 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PSTPIP2-204ENST00000589328 2900 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SPIN2A-202ENST00000374908 2468 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DCAF11-202ENST00000396936 2469 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 HLF-208ENST00000573945 2977 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AC004801.7-201ENST00000624535 2973 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RCBTB1-202ENST00000378302 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNH6-201ENST00000314672 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ADGRE5-202ENST00000357355 3054 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MLH1-221ENST00000536378 2567 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KCTD7-209ENST00000640385 4118 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NGRN-202ENST00000379095 7237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF701-201ENST00000301093 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ATAT1-201ENST00000318999 2611 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CDHR3-211ENST00000478080 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PXYLP1-202ENST00000393010 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNE1-204ENST00000399289 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MRPL22-207ENST00000523037 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PLEKHA5-203ENST00000429027 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM47B-201ENST00000329357 2120 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZBTB18-202ENST00000622512 3740 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 HNRNPR-203ENST00000374616 2691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MAMLD1-205ENST00000432680 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CNGA3-203ENST00000393504 3841 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms