Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ALDH1L1-203ENST00000393434 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TSPAN18-201ENST00000340160 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008543.1-201ENST00000344893 3383 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ITIH1-211ENST00000537050 2493 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 APP-201ENST00000346798 3467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TNS3-201ENST00000311160 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PDE4C-210ENST00000597297 1559 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 EML1-202ENST00000327921 3715 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 API5-201ENST00000378852 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC25A14-215ENST00000612248 1734 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 MESD-206ENST00000561312 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PKD1L2-205ENST00000527937 4165 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TEX11-203ENST00000374333 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 KIR3DL1-201ENST00000326542 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CECR3-201ENST00000428828 1915 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 RGS3-207ENST00000374140 4591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC144B-208ENST00000618081 8688 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 TRUB1-201ENST00000298746 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 MDC1-201ENST00000376406 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 NEXMIF-201ENST00000055682 11719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CBL-203ENST00000634586 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNH8-201ENST00000328405 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 IGSF3-202ENST00000369483 7326 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CYCS-201ENST00000305786 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 IMMT-202ENST00000409051 2515 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFAT-202ENST00000429442 4421 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 AC145207.5-201ENST00000582866 2682 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 DDX52-213ENST00000617633 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 LCA5-203ENST00000467898 2894 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 ZIK1-207ENST00000599456 2860 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
KRTAP9-9Q9BYP9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms