Protein–RNA interactions for Protein: V9GYY9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYY9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
V9GYY9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
V9GYY9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
V9GYY9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms