Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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SNX13Q9Y5W8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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SNX13Q9Y5W8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX13Q9Y5W8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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SNX13Q9Y5W8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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SNX13Q9Y5W8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
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SNX13Q9Y5W8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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SNX13Q9Y5W8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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SNX13Q9Y5W8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNX13Q9Y5W8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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