Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIF3AQ9Y496 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIF3AQ9Y496 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms