Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP11Q9Y3A2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms