Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms