Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX12Q9UMY4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms