Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMX5

NENF, Neudesin, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENFQ9UMX5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NENFQ9UMX5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NENFQ9UMX5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms