Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRDM4Q9UKN5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRDM4Q9UKN5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms