Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VAX2Q9UIW0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAX2Q9UIW0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms