Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX20Q9UHI6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX20Q9UHI6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms