Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN8Q9UBY8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLN8Q9UBY8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms