Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SAE1Q9UBE0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAE1Q9UBE0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms