Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ORC3Q9UBD5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ORC3Q9UBD5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms