Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB6BQ9NRW1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RAB6BQ9NRW1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms