Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX2Q9NRD8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX2Q9NRD8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX2Q9NRD8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX2Q9NRD8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX2Q9NRD8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX2Q9NRD8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX2Q9NRD8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX2Q9NRD8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX2Q9NRD8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX2Q9NRD8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX2Q9NRD8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX2Q9NRD8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX2Q9NRD8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX2Q9NRD8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX2Q9NRD8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
DUOX2Q9NRD8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms