Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPJQ9HC77 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms