Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPF2Q9HAU5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms