Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
DCLRE1BQ9H816 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCLRE1BQ9H816 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms