Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms