Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFHD1Q9BUP0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms