Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUE0

MED18, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED18Q9BUE0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MED18Q9BUE0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MED18Q9BUE0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MED18Q9BUE0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MED18Q9BUE0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MED18Q9BUE0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MED18Q9BUE0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MED18Q9BUE0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MED18Q9BUE0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MED18Q9BUE0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MED18Q9BUE0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED18Q9BUE0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED18Q9BUE0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED18Q9BUE0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED18Q9BUE0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED18Q9BUE0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED18Q9BUE0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED18Q9BUE0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED18Q9BUE0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MED18Q9BUE0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms