Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
THUMPD2Q9BTF0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
THUMPD2Q9BTF0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
THUMPD2Q9BTF0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
THUMPD2Q9BTF0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms