Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
RTKNQ9BST9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RTKNQ9BST9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms