Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM7Q9BQ49 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM7Q9BQ49 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms