Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SORCS2Q96PQ0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms