Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NSMCE2Q96MF7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NSMCE2Q96MF7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms