Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VCPIP1Q96JH7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms