Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPNQ96H22 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms