Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMIGD2Q96BF3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.3 ms