Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR2Q969E8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR2Q969E8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms