Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BHMTQ93088 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms