Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PYDC1Q8WXC3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms