Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RUFY2Q8WXA3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RUFY2Q8WXA3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms