Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC4Q8WW27 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms