Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC148Q8NFR7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC148Q8NFR7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms