Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE23Q8NDY6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms