Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CARMIL3Q8ND23 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL3Q8ND23 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms