Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z2

CCDC71L, Coiled-coil domain-containing protein 71L, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71LQ8N9Z2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71LQ8N9Z2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC71LQ8N9Z2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC71LQ8N9Z2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC71LQ8N9Z2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC71LQ8N9Z2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71LQ8N9Z2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71LQ8N9Z2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71LQ8N9Z2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71LQ8N9Z2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71LQ8N9Z2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71LQ8N9Z2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71LQ8N9Z2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms