Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM71DQ8N9W8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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