Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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