Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP43Q70EL4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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