Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEM1Q6ZVN7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEM1Q6ZVN7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEM1Q6ZVN7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEM1Q6ZVN7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEM1Q6ZVN7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEM1Q6ZVN7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEM1Q6ZVN7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEM1Q6ZVN7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEM1Q6ZVN7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEM1Q6ZVN7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms