Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C16orf54Q6UWD8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C16orf54Q6UWD8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms