Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 DIXDC1-207ENST00000614104 559 ntTSL 48.86□□□□□ -0.993e-18■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 PSMC1-203ENST00000553835 390 ntTSL 38.81□□□□□ -12e-7■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 ABT1-201ENST00000274849 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.172e-10■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 AP2A2-219ENST00000530801 557 ntTSL 47.1□□□□□ -1.274e-12■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 GPBP1L1-212ENST00000495616 594 ntTSL 26.78□□□□□ -1.323e-18■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 FN1-227ENST00000498719 2433 ntTSL 26.78□□□□□ -1.323e-18■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 VPS13B-206ENST00000496144 5625 ntTSL 56.57□□□□□ -1.362e-8■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 ZNF600-204ENST00000598369 650 ntTSL 36.51□□□□□ -1.373e-18■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 AL137782.1-202ENST00000570285 386 ntTSL 56.15□□□□□ -1.431e-8■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 LARP1B-206ENST00000507259 1513 ntTSL 1 (best)5.8□□□□□ -1.481e-7■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 CTR9-202ENST00000524523 902 ntTSL 55.79□□□□□ -1.483e-18■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 SNX13-208ENST00000482558 1139 ntTSL 25.76□□□□□ -1.493e-18■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 ZNF600-205ENST00000599893 600 ntTSL 35.6□□□□□ -1.513e-18■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.583e-18■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 ZNF600-202ENST00000594028 506 ntTSL 24.57□□□□□ -1.683e-18■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 MTHFD1-216ENST00000557539 509 ntTSL 44.46□□□□□ -1.71e-9■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.728e-9■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 RFWD2-209ENST00000491600 773 ntTSL 54.14□□□□□ -1.753e-18■■■■■ 36
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PRPF8Q6P2Q9 AP2A2-209ENST00000526753 464 ntTSL 43.28□□□□□ -1.884e-12■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 ZNF600-203ENST00000597124 333 ntTSL 33.25□□□□□ -1.893e-18■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 UCHL3-202ENST00000419068 824 ntTSL 53.14□□□□□ -1.911e-8■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 MRPL3-206ENST00000510043 640 ntTSL 23.07□□□□□ -1.929e-7■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 RFWD2-210ENST00000498306 617 ntTSL 52.98□□□□□ -1.933e-18■■■■■ 36
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PRPF8Q6P2Q9 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.295e-6■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 MRPL42-205ENST00000549561 775 ntTSL 3-0.36□□□□□ -2.475e-6■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.76e-17■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.866e-17■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 CRELD2-210ENST00000487969 2622 ntTSL 212.04□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 36
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PRPF8Q6P2Q9 RAD54L-203ENST00000459678 775 ntTSL 58.13□□□□□ -1.119e-8■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 P3H3-210ENST00000545596 567 ntTSL 216.14■□□□□ 0.171e-9■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.131e-9■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.291e-9■■■■■ 36
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PRPF8Q6P2Q9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.371e-9■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.471e-9■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 SLC29A2-203ENST00000540386 2474 ntTSL 1 (best)12.04□□□□□ -0.481e-9■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 AC120114.5-201ENST00000562285 556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.861e-9■■■■■ 36
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PRPF8Q6P2Q9 DNAJC25-202ENST00000447096 2498 ntTSL 1 (best)16.19■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 DNAJC25-203ENST00000463589 2572 ntTSL 514.67□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 36
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PRPF8Q6P2Q9 NUP50-205ENST00000419387 1018 ntTSL 38.06□□□□□ -1.128e-12■■■■■ 36
PRPF8Q6P2Q9 HACD2-202ENST00000469317 590 ntTSL 313.11□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 36
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PRPF8Q6P2Q9 FANCA-230ENST00000568369 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.013e-7■■■■■ 36
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PRPF8Q6P2Q9 PRC1-201ENST00000361188 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.858e-7■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 PRC1-202ENST00000394249 3034 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.048e-7■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPA1-208ENST00000548688 711 ntTSL 36.3□□□□□ -1.43e-10■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 RETSAT-202ENST00000409984 765 ntTSL 210.29□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 DENR-204ENST00000539463 671 ntTSL 221.9■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 EIF4G2-204ENST00000525606 690 ntTSL 21.24□□□□□ -2.212e-18■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 EIF4G2-230ENST00000534470 520 ntTSL 2-0.67□□□□□ -2.522e-18■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 XRCC5-205ENST00000451695 415 ntTSL 51.49□□□□□ -2.179e-10■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 MLLT10-210ENST00000468309 647 ntTSL 33.28□□□□□ -1.883e-12■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 AGAP3-223ENST00000492234 560 ntTSL 410.98□□□□□ -0.659e-12■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 AGAP3-214ENST00000476375 1019 ntTSL 510.79□□□□□ -0.689e-12■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.341e-11■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 CAMK2G-210ENST00000472912 2629 ntTSL 211.37□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 CAMK2G-201ENST00000305762 1820 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.013e-7■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 CAMK2G-206ENST00000394762 3767 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.053e-7■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 CAMK2G-203ENST00000322680 3818 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.063e-7■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 CAMK2G-207ENST00000423381 3824 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.093e-7■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 CAMK2G-202ENST00000322635 3720 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.123e-7■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 CAMK2G-204ENST00000351293 3563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.133e-7■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 COL4A5-202ENST00000361603 6469 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.058e-7■■■■■ 35.9
PRPF8Q6P2Q9 COL4A5-201ENST00000328300 6483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.058e-7■■■■■ 35.9
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