Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD54Q6NXT1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms